當前我國海洋經濟存在三大發展短板
　　
　　高端配套服務業發展緩慢。2015年，我國海洋產業結構中，一二三產業占比分別為5.1%、42.5%、52.4%。但與發達國家相比，我們在技術水平、管理水平及配套服務等方面還存在明顯差距，海洋金融服務、海洋物流服務、海洋工程技術服務、信息服務等高端服務業發展較為緩慢
　　
　　產業發展同構化明顯。通過計算我國11個沿海省市區的海洋產業結構相似系數可以看出，大部分省市區間的產業同構系數值高達0.9以上。這說明海洋產業結構相似度非常高，產業同構化現象十分明顯。這一問題得不到解決，將加劇各地惡性競爭，加劇資源浪費、環境污染、發展效率低下等問題
　　
　　海陸經濟一體化程度不高。通過計算反映海陸經濟一體化的耦合度指標，發現我國沿海地區海洋經濟系統與陸域經濟系統相互作用、相互影響的程度較低，協調度也不高。除個別年份、個別地區是高強度耦合外，其余都是中強度耦合。這說明我國沿海地區海陸經濟一體化程度普遍不高
　　
　　我國自2012年11月提出海洋強國戰略以來，海洋經濟迅猛發展，已經成為沿海地區經濟新引擎。但與此同時，海洋經濟結構性矛盾依然存在，海洋產業同構化程度明顯，岸線資源利用率較低，海洋科技對海洋經濟的拉動力不強，海洋經濟系統與陸域經濟系統耦合度不高。
　　
　　對此，有必要采取相關應對策略。
　　
　　集約化——完善現代海洋產業新體系。一是創新發展海洋先進制造業。借力“中國制造2025”之東風，對海洋船舶工業、海洋工程裝備業、郵輪游艇制造業等制造業植入“智慧基因”。二是提升發展海洋現代服務業。現代海洋服務業處在海洋產業鏈的高端，是現階段海洋經濟增長的新亮點。在改造提升濱海旅游、海洋運輸等傳統服務業的同時，大力發展海洋金融、海洋信息服務等新型海洋服務業。三是培育發展海洋戰略性新興產業。隨著海洋新興產業的興起和發展，要大力發展海陸產業關聯度較高的海洋生物醫藥、海洋新能源等戰略性新興產業。四是轉型發展海洋現代漁業。居于主導地位的海洋漁業，需要運用先進技術進行改造，實現產業結構的優化升級。
　　
　　一體化——推動海陸產業要素流動。這具體體現在資源流動、資金循環、技術傳播和勞動力轉移上。要構建全要素耦合的海陸一體化經濟體系，首要的是破解陸海分割、部門分割、區域分割的制度短板，加強海洋行政部門的交流溝通，減少事務的交叉重復，積極推進海洋綜合管理試點工作，對管理職能進行整合，實現海陸資源開發的統一協調和規劃。
　　
　　高端化——驅動海洋科技創新。要完善海洋科技管理和政策機制，科學界定政府和市場在海洋科技創新中的行為邊界，研究制定海洋科技創新的權責清單、負面清單和服務清單；完善海洋科技成果轉化“利益共享”分配機制；要瞄準世界海洋科技前沿，聚焦重大關鍵性和共性技術，在載人深潛器、深海水下油氣生產、海洋新能源、海洋工程裝備、海底探測、海洋生物醫藥、海水養殖生物遺傳育種、海水淡化、海洋信息技術、海洋災害預警與減災、海洋生態保護等領域，形成一批創新成果；要以重大項目為紐帶，建設涵蓋政、產、學、研、金的海洋科技協同創新戰略聯盟。
　　
　　協同化——整合區域海洋協作。一是沿海省市區要加強與主要流域經濟帶的省市合作，實施“通江達海”策略，擴大經濟和資源腹地，打通江海大通道，提高國際海運通道保障能力。二是沿海省市區要加強海洋經濟合作，充分發揮各自的優勢，增強服務國家戰略、服務內陸地區的輻射和帶動能力。三是加強沿海沿江港口分工協作，增強江海、海陸、海空多式聯運能力，培育內河集裝箱市場發展，加快形成便捷高效的港口、航運信息交換系統。
　　
　　可持續性——注重海洋資源開發保護。要認識新常態，立足自身資源稟賦，充分認識海洋資源分布特點，合理開發海洋資源；要適應新常態，挖掘現有海洋資源開發潛力，加快海洋資源勘探、測繪和開發可行性論證，提高海洋資源綜合開發利用水平；要引領新常態，發揮市場配置資源的決定性作用，優化海洋資源開發。總之，應該始終堅持在資源約束和環境承載力的條件下推動海洋經濟發展，加強海洋資源的保護性開發，實現海洋經濟可持續發展。